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虽然朝廷已经紧急下达命令，但是急递并没有带来什么好消息，倭寇在芜湖虽然受挫，但是并没有遏制倭寇向南京袭扰的步伐，南直隶急报：南陵倭流劫至芜湖，纵火烧南岸，突渡北岸，入市，各商民、义勇登屋，以瓦石、灰礶击之，贼多伤者，遂奔去。各商、兵下屋，生缚二倭，斩首十级。
接到芜湖传来的消息，大明君臣不禁有些哭笑不得，朝廷的官军、民壮遇贼即溃，反倒是百姓们组织起来，将这伙倭寇赶出了芜湖。强悍的倭寇登岸北岸时，无城垣可守的芜湖，商民、义勇登上屋顶，用最简单的瓦石、灰礶向敌人投掷。这样最原始的武器，却将倭贼打得昏头转向。
自浙江登岸以来，他们从未见过如此彪悍的百姓，不计生死，奋不顾身。被砸伤多名的倭寇，觉得此地危险，竟然下船奔走。
越战越勇的芜湖百姓，看到敌人逃遁，商民、兵壮迅速追赶，生擒两人，打死十人。仅剩五十余人的倭寇，逃之夭夭。
倭寇自芜湖退走之后，尚余53人，他们继续北上，更加猖狂，给整个大明带来了巨大震撼。
这伙倭寇灰溜溜北上，继续沿着长江，抵达太平府。
此时，操江巡抚史褒善正在太平府城中，得知倭寇进犯后，他紧急派遣一名千户，率领数量众多的乡兵、义勇、杀虎手，出城剿敌,在马厂与倭寇作战。
又一次，毫无意外的“大败”。
在芜湖，倭寇被普通百姓打得落花流水；在太平府，与正规军作战，他们却虎虎生威。嘉靖和朝廷闻报，已经不能用震惊来形容了，嘉靖竟然没有召见一名大臣商量此事，而是冷眼旁观。
紧接着就是漕运都御史郑晓的急报来了，郑晓的奏疏是弹劾史褒善的，堂堂留都门户，偌大的太平府城，惊慌失措的府城内官员，竟然采取了最消极的办法，太平府城城高堑深，守城兵壮无心剿敌，却砍断护城河的河桥，让倭寇无法入城。以此来“御敌”。
史褒善一代名臣，位列封疆大吏，大敌当前，竟然能出此“良策”，智谋尚不及芜湖百姓，郑晓一面与漕运总兵临淮侯李庭竹提兵赶赴南京设防。
倭寇看到太平府城如此英勇，并未久留，继续北上，直接冲击留都城外的江宁镇。江宁镇乃是南京城外的最后一道防线了，南京兵部尚书参赞机务张经并非不知兵的人，他知道江宁镇的重要性，亲自指挥朱襄统率官军镇守。
当然，张经如果知道朱襄是个什么货色的话，肯定能在南京兵部大堂就掐死他。
倭寇突入江宁镇时，这位指挥使朱襄竟然在饮酒作乐，不亦乐乎。倭寇杀入江宁镇，朱襄正袒裼纵酒。接到战报后，他仓猝率兵迎战，结果全军覆灭。官军与五十几名倭寇作战，官兵死者多达三百多人。他所率的官军崩溃，江宁镇惨败，最直接的后果：留都南京门户洞开，倭寇直驱留都城下。
这下大明朝的底裤连带着嘉靖的底裤都没有了，唐顺之、戚继光等都提兵赶赴南京，最先赶到的是总督漕运都御史郑晓和漕运总兵李庭竹，结果这二位连南京城都没进去。
南京戒严，十三城门尽锁。
城内有南京兵部尚书参赞机务张经、南京兵部侍郎李天宠，守备南京兼掌中军都督府事的魏国公徐鹏举，司礼监秉笔太监内守备冯保，有驻守兵马十二万。
这伙倭寇将南京的大明官军的脸面按在地上摩擦了一把，南京锦衣卫的奏报称：贼遂直趋南京。其酋衣红乘马，张黄盖，整众犯大安德门。我兵自城上，以火铳击之，贼沿外城小安德门、夹冈等门，往来窥觇，会城中获其所遣谍者，贼乃引众，由铺岗趋秣陵关而去。
这伙倭寇的另一个秘密也揭露出来。
抵达南京城之前，倭寇提前派遣了间谍进入城内侦查，间谍应当对南京城相当熟悉，倭寇早已知悉城内动向。
倭寇队伍每次前进，都会派出间谍侦查前方信息。这些间谍很可能通晓中文，乍看起来，与大明人无异，以至于一直未被发现。
南京城大门紧闭，明兵自城上用火铳射击。倭寇头目竟然大模大样的“衣红乘马，张黄盖”。
如此招摇，就是要吸引城上注意。倭酋这样的装扮，就是仿照大明皇亲贵胄的銮仪卫的模样。
这伙倭寇本来准备自秣陵关向南逃窜，应天推官罗节卿、指挥徐承宗，率兵千人守关，望风奔溃。贼遂过关。南都应天府繁华之区，倭寇如入无人之境。十数万官军，对这伙倭寇无可奈何。
倭寇长驱直入溧水县杨林桥，大明的民壮又是同样的掉链子，典史林文景率兵迎遏，不能御。署县县丞赵珠臣，直接弃城而走。
这次是倭寇第二次进入县城。进入城中后，他们竟然如此“惬意”：
贼遂由小北门入城，宴饮民家，信宿乃去。
一路上的“所向披靡”，让他们放心在城内大吃大喝。住了一晚后，他们才不紧不慢的离开，此后，他们流劫溧阳，趋宜兴。其猖獗程度，已无以复加。
不过他们的好运也就此终结了，倭寇原本打算从紧邻宜兴的太湖，沿着水路，向大海逃窜。因为现在在陶宅港也有一伙倭寇，如果两支倭寇汇合，更难对付，将成大患。
这时自苏州提兵赶来的南直隶巡抚唐顺之在前方堵截，后面是郑晓、李庭竹所率的漕兵，在两路官军的夹击之下，这伙倭寇困兽犹斗，杀伤官军百余人后被官军阵斩，无一漏网。
消息经急递传到京师，科道言官疯狂上疏，从南京兵部尚书张经、南京守备徐鹏举、浙直总督赵文华、浙江巡抚胡宗宪、南直隶巡抚唐顺之，和各路总兵，都被言官们疯狂弹劾。
嘉靖对这些奏疏，一律留中，无逸殿内，嘉靖召集内阁和兵部，将这段时间的所有塘报拿出来。