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宇宙依旧在默默的运行着，如同永恒……
在血瞳迷茫的这段时间里，克罗迪尔的文明快速发展。
围绕着原始胚胎，他们发展出一条新的生物科技路线。战侍和原始的专属战士开始出现在克罗迪尔对外征服的舞台中。而殖装也获得巨大改变，开始摆脱原始芯核的结构，发展出一种介于能量和生物之间的新核心。大型生物兵器‘冢体‘和寄生细胞集群‘种体’开始出现。
这一阶段的克罗迪尔人是近乎无敌的，凭借着与众不同的生物文明，他们在宇宙中打下了偌大的疆域。任何文明，不管是机械文明还是能量文明，都无法阻挡他们征服的脚步。一个个星域被占领，一个个文明被征服。克罗迪尔文明如瘟疫般蔓延，迅速侵占了大片的星空。
扩张，再扩张。
一代代的征服者永不停止，而在战侍和专属战士的支持下，克罗迪尔人摆脱了人手不足的缺陷，从而爆发出恐怖的侵略性。
他们通过征服来掠夺资源，同时将被征服的文明纳入体系。形成了一个类似金字塔形态的等级社会。克罗迪尔人是这个社会的第一群体，而其他种族则按照克罗迪尔人的需求一一排列。其中，一些强力种族被克罗迪尔人专门提取出来进行了广域调制。从而成为专属战士的后备梯队。
他们称这些强力种族的原始家乡为……
‘战士之眠’。
这一阶段克罗迪尔的战争模式初步成型，形成了以征服者为主体，下辖战侍和专属战士的侵略单位。无尽的战斗促进了克罗迪尔人的进化，渐渐的主宰者出现了。他们人数极少，却拥有强大到令人绝望的战斗力。成为克罗迪尔文明的新星。
当然和另一个人相比，主宰者的出现就不那么耀眼了。
他的名字叫做‘希尔斯’，是一名智者。
他用了一百七十二年的时间破解了原始胚胎的基因密码，从而发现了一个隐藏极深的秘密。
那就是克罗迪尔人的缺陷并非来自基因本身，而是来自一种神秘的存在。充满了灵能的意味。灵能又属于神秘学的范畴，所以简单来说的话也可以形容为灵魂。克罗迪尔人，早在灵魂阶段就被埋下了厄运的种子。
人造生命是没有灵魂的，因为那是神的领域。但克罗迪尔人却有，这又再次打破了常识。
这个发现极为重要，第一次确认了克罗迪尔人噩梦的起源。也引起了第二代王的关注。他为此调集了整个文明三分之一的智者，试图破解这一切。可结果却让所有人失望。灵魂学本就是神秘学中的一部分，而神秘学又是宇宙公认最玄妙。最没有道理的学科。指望用常规手段破解克罗迪尔人灵魂的秘密无异于天方夜谭。
七千八百名智者用去了近百年时间也无法找到一丝线索。最终几近绝望。
可就在这时，事情有了转机。
外出的征服者发现了一个新文明。这是一个奇特的文明，它的名字叫做‘马尔克’。
这个文明并非承载于一般的星体，而是一处神秘的偏移位面。这里没有一般意义的宇宙环境，而是无尽的云海。一颗无法想象的巨树成为唯一的主体。马尔克族就生活在这颗古树上，与云海微风为伴。这里的美丽宛如梦幻，没有亲身到达这里的人永远无法想象这里的一切。同时因为与世隔绝的原因，马尔克族的女孩天真纯洁，毫无尘世的心机。她们完美的如同梦幻般的精灵，整天欢笑着飞舞在古树之上。她们美貌如花。如天使降临，它们心灵手巧。能够编织出宇宙中最完美的画卷。
因为一次征伐的失败，一个重伤垂死的征服者偶然的进入了这个地方。当时他已经几近死亡，却被马尔克女孩救了起来。在他睁开眼睛的一刹那，几乎以为自己遇到了天使。
从此，马尔克作为克罗迪尔新的盟友文明，对宇宙打开了大门。
马尔克女孩拥有极为神奇的能力，她们会做梦。通过做梦。她们可以走入受术者的灵魂，抚平一切心灵的创伤。这种能力对克罗迪尔征服者很重要。可以让他们沸腾的鲜血暂时平息，获得一份难得的安宁。王极为重视这种能力。希望通过这种能力来继续探索克罗迪尔人灵魂的缺陷。
在这段时期，克罗迪尔前所未有的停止了征伐。进入短暂的休整期。
与此同时，克罗迪尔过度征伐的后遗症开始显现出来，整个宇宙，都开始渐渐警惕克罗迪尔。很多高等文明更不动声色的减少了与克罗迪尔的沟通。
不过这时候克罗迪尔的王已经顾不得其他了，因为他们发现了一个惊人的秘密，那就是马尔克女孩的梦不仅仅可以沟通灵魂，更能进入一些从未被人踏足的领域。比如……
深渊。
在一次偶然的机会，一名马尔克女孩的梦不小心掉进了深渊。并在深渊的最底层发现了两个诡异的物体。她未能及时返回，只将这个信息传回后就彻底消失在深渊之中。
深渊之下居然有物质存在？
当这个信息传回，几乎所有人都露出不敢相信的目光。可当初克罗迪尔人的实力，无论如何也无法进入那里。只能望而兴叹。
时间一点点过去，转眼又是千年，第二代王最终没能逃脱宿命的梦魇，彻底消失在王座之上。但他早已留下了传承，克罗迪尔的第三代王诞生。
这时克罗迪尔已经强盛到令人恐惧的地步。哪怕在整个宇宙，它都是一个庞然大物。强大的武力造就了辉煌的疆域，同时也越发激起了其他文明的敌意。更多的高等文明开始与克罗迪尔人断绝往来。不知不觉中克罗迪尔文明成为宇宙的孤岛。
而这时，克罗迪尔的武力也到达巅峰，出现了如冥王迪尔克，战神雷亚这样的强大战士。受此影响，克罗迪尔停止休整，在千年之后再一次开启了战端。
而就在这个时候，马尔克族的主星上，一个女孩刚刚睁开双眼，从睡梦中醒来。
她的手中，紧紧抱着一团漆黑的雾气，其中泛起黑红两色的电光。如同恶魔之眼。
它……来自深渊。