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尽管已经实行了如此严厉的法律，还是有人不顾一切出门逃生。这些人基本上都是家里没有粮食没有水，无法待在家中继续活下去。唯有想办法逃出来寻找生路，或者想去投奔亲戚，或者企图逃上城楼跳入洪水离开这座可怕的城市。
但是大街小巷都布满了巡逻的兵士，这些人都没能够达到目的，都死在了兵士的刀箭之下。
而巡逻的兵士也并没有能够幸免于难，兵士中也在迅速传播着瘟疫。经常能看到的就是巡逻的兵士会突然有人掉队，并倒在街边，大口地吐着鲜血，很快死去。
刚开始这种场景使得巡逻的士兵们惊恐万状，很是害怕。可到了后面，他们也麻木了。对倒下的同伴甚至已经没有人上前去管，因为他们每个人都害怕会因此染上瘟疫。
官府衙门的广场上，焚烧尸体的烟雾几乎就没断过，白日黑夜的一直烧着。因为不断的有尸体被送来，那些焚烧尸体所用的木材，原本用的是衙门厨房积攒的木头。可这些木材很快就用光了，于是便拆掉了衙门的一些旧房子拿来烧。
到了后面，衙门已经没有可以拆的房子了。这时候，京城里已经有一些人家都死绝了，又是贫困人家，家里没什么钱财的，于是便将这些房子也拆了用来焚烧尸体。
焚烧尸体的开封府衙门大院距离皇宫还是有些远的，但是站在皇城之上是还是可以看见从开封府大院飘起的滚滚浓烟。便可知道那是在焚烧瘟疫病人的尸体，这种烟雾滞留在空中，久久没有散去。
宋神宗在他的宫殿遥望天空，也能看见空中飘散的黑烟。他当然知道是怎么回事，心情异常沉重。这些烟雾白天黑夜就没断过，说明因为瘟疫死亡的人就没有断过，而且还越来越多。因为天上的黑烟越来越浓，到后来，几乎遮挡住了半个天空。
宋神宗已经连续下了几道圣旨，责令太医院尽快研制出治疗这种可怕瘟疫的有效药方来。但是下圣旨容易，要找到这样的方剂却很难。
太医院王院判已经急得跟热锅上的蚂蚁似的了，皇帝天天逼他，甚至不时把他找去训斥。每天他都要在紧张不安和惶恐中度过，所以他转过来又向下面的太医施加压力。这些太医一个个愁眉苦脸，没日没夜的蹲在太医院的藏书阁中查阅经典古籍，寻找有效的治疗方案。而太医院的医馆就是他们验证药方的试验场，患了病的官员及家属都会被送到这来救治，而不会象普通百姓那样被直接射杀或者将尸体火化。
这样一方面体现了对官员的特殊照顾，同时也给太医院的太医们一个试验药方的机会。只可惜这些太医找了数百个方子，引经据典，但是都没有任何作用。
就在这时，司马光上了一道奏折，保荐杨仙茅为太医院的御医。
宋神宗也听过杨仙茅的名号，知道杨仙茅是吴王的女婿，这在政治上是绝对可靠的。在医术上，他听说杨仙茅在治疗前一阶段瘟疫的成功率相当高，远远高于其他医馆的郎中。虽然对后面的这种新的瘟疫他也没有拿出好的方案来，但是如果把他招入太医院与其他太医共同商议，同时利用太医院丰富的皇家藏书，以他的聪明才智，或许就能最终找到治疗这种可怕瘟疫的药方来。
按理说要成为一个太医，那可不是掌握一两个偏方就能够当上的。必须有丰富博学的医学才能，并且在杏林界得到广泛认可，而且根正苗红知根知底的人才能进入太医院。
现在杨仙茅年纪太轻了，正常情况下，即便有司马光的保荐，宋神宗可能也会掂量一下，让他先到地方做几年医官，看看他的成就和表现。如果可以，再招他进太医院，又或者在太医院有疑难杂症时让他参与会诊，以便考验他的才学。
但是现在宋神宗没有选择，因为瘟疫已经使京城大量的民众死亡，甚至包括朝廷的官员和家属。虽然皇城采取了严密的控制手段，至今还没有出现瘟疫，但并不表示永远不会。一旦瘟疫在皇城中扩散开来，宋神宗不敢想象由此带来的后果会怎样。
所以他愁得寝食难安，像掉进洪水中的将死之人，但凡抓到什么东西，即便是一根稻草，也会当做救命的依托，更何况还是他最为欣赏的忠臣司马光的保荐。他相信司马光的眼光，于是几乎没有犹豫便下了旨，招杨仙茅入太医院为太医，并参与研制治疗瘟疫的药方的工作。
这道圣旨被送到杨仙茅医馆的时候，杨仙茅正在跟妻子白芷郡主商议，这种情况下要如何继续与药香郡主联络，以便继续生米煮成熟饭的计划。
现在看来这个计划实施难度很大，因为润王夫妻和药香郡主都在皇城里面。而皇城是严格控制着不让与外界连通的，这也是是皇城成为这一次瘟疫中的没有染病的孤岛的原因。
杨仙茅和白芷郡主商议的结果就是，现在只怕没有办法执行这个计划了。即便是要以为药香郡主看病为由接近她或把她接出来，就算是润王都不会答应。因为目前来看药香郡主并没有重新犯病的迹象，这两日只能先缓一缓，等到过了瘟疫再说。
正在两人想不出更好的办法时，皇宫传来了圣旨。
杨仙茅摆下香案，将传旨太监迎了进来。
传旨太监展开圣旨宣读，任命杨仙茅为太医院太医，即刻随同传旨太监一起进宫。杨仙茅的其他亲属则不能跟随，只能一人前往。
杨仙茅收到这一则圣旨当真是又惊又喜，因为他正跟白芷郡主两人商议，如何才能够继续执行生米煮成熟饭的计划。毕竟他要把药香郡主也娶过门才能破解他的五弊三缺。
如果这个目标能达到，杨仙茅想得就是带上妻子和干娘以及忠实的丫鬟刘冬雁乘坐大大鹏鸟飞回到一百年前与妻儿团聚。他先前算了一下，大鹏鸟巨大的后背应该能放得下他们这几个人，但更多就不行了，只能放弃。
要是强行把白芷郡主带走，只怕不符合老天爷的旨意就达不到破解五弊三缺的要求，这种情况下很可能会出现上次他携带他带着卓玛王妃穿越时光隧道时，王妃被凝固在时光时空隧道中的情况。
而现在皇帝给了他一个机会进入皇宫，药香郡主就在皇宫之内，那他也就可以跟药香郡主见面，从而继续实行执行他的生米煮成熟饭的计划了。所以杨仙茅立刻手捧圣旨恭声道：“微臣谢主隆恩。”
他现在已经是太医，是正七品的官员，自然可以有资格称微臣了，虽然这个职务比他前世差了不是一星半点，但是他对这个并不在意。他一门心思想的就是如何才能把药香郡主娶过门，然后带着他们远离这可怕的瘟疫，返回到一百年前去，这才是他的最终的目的。
杨仙茅让传旨太监稍事休息，而他尽直到屋里把圣旨的事与唐氏和白芷郡主说了，唐氏和白芷郡主都很高兴。这当真是想睡觉，便有人送上枕头。
杨仙茅要离开的话，家里头就好像失去了主心骨似的，杨仙茅叮嘱她们，现在外面全都是兵士，不容许任何人随意走动，因此他们只要待在宅院里头就是安全的。而宅院里头有足够他们吃很久的粮食和干净的水源，生活是没有问题的。
而他现在已经是官员了，根据传旨太监所说的，官员是允许家人送信到皇城里头通报家里的情况，以便在宫中的人安心办事。同时官员的家属如果生病，还可以送到太医院的医馆进行救治。只要不是瘟疫，那就没有问题。假如患了瘟疫，那不管他呆在哪里只怕都难逃一死，这一点倒是都可以理解。
安顿好家里的事务之后，杨仙茅便与家人辞别。跟着传旨太监一起进宫去了。
杨仙茅跟着传旨太监来到皇宫，距离皇宫还有一大段距离的时候，皇宫门口的卫兵便警惕的弯弓搭箭指向了他们。
传旨太监拿出腰牌用力扔了过去，腰牌落在地上，守门的兵士也不上前去捡，只是弯腰盯着看了看，然后用手里的单刀轻轻一挑，把腰牌翻了一面看背面的字。看完之后才倒转刀柄抱拳拱手说：“得罪了，公公和杨太医请进。”
说罢迅速退了开去，传旨太监对杨仙茅说道：“没办法，我们进去之后要严格的沐浴更衣，这是费太医想出来的招。等一会儿我们进去之后，要在一个房间里把所有的衣服都脱下来，扔到一个筐里头，他们要拿去烧掉。然后我们换成宫里的衣服再进去，这之前还要用药水冲洗过后才能进去，这药水也是费太医他们配置的。”
杨仙茅点头说道：“应该如此，若不是执行严格的隔离，只怕这病就要传到皇宫里来了。”
走到近前，那太监从地上捡起自己的腰牌。守城的兵士已经将城门打开，两人走了进去。这时一位兵士手持兵刃说道：“请两位沐浴消毒换衣后方能进去。”